国内（九州）

福岡

野口遺跡・曽根遺跡・十楽B遺跡・橋本一丁田遺跡・四箇A遺跡・四箇B遺跡・才田下原遺跡・那珂遺跡・江辻遺跡・大原D遺跡

佐賀

西唐津海底遺跡・東名遺跡・大野遺跡・西畑瀬遺跡・東畑瀬遺跡

長崎

権現脇遺跡・大野原遺跡・肥賀太郎遺跡・礫石原遺跡・筏遺跡・宇木汲田遺跡・越高尾崎遺跡・佐賀貝塚遺跡・越高遺跡・女夫石遺跡・中島遺跡・頭ケ島白浜貝塚遺跡

熊本

新屋敷遺跡・上南部A遺跡・上南部B遺跡・瀬田池ノ原遺跡・四方寄A遺跡・宮山遺跡・牛草遺跡・方保田東原遺跡・西平貝塚遺跡・南福寺貝塚遺跡・御領貝塚遺跡・北久根山遺跡・渡鹿貝塚遺跡・大野貝塚遺跡・三万田遺跡・熊本大学本荘医学部遺跡・黒髪遺跡群北・黒髪遺跡群南・江津湖遺跡・山王遺跡・扇田遺跡・吉原遺跡・苗代津遺跡・大原遺跡・木船西遺跡・託麻弓削遺跡・石の本遺跡・太郎迫遺跡・ヲスギ遺跡・黒橋貝塚遺跡・鶴羽田遺跡・山海道遺跡・万楽寺遺跡・天城遺跡・ワクド石遺跡

大分

石井入口遺跡・飯田二反田遺跡・横尾貝塚遺跡・法垣 大坪遺跡

宮崎

本野原遺跡・黒土遺跡・正坂原遺跡・星原遺跡・上床遺跡・南中原遺跡・湯牟田遺跡・赤坂遺跡・上針谷 下針谷遺跡・右葛ケ迫遺跡・王子原遺跡・筆無A遺跡・筆無B遺跡・椨粉山遺跡・市納上第2遺跡・国光原A遺跡・王子山遺跡・加治屋B遺跡・坂元B遺跡・中尾山遺跡・大岩田村ノ前遺跡・上猪ノ原遺跡・広原第1遺跡・山中遺跡・大谷遺跡・生駒遺跡・内野々遺跡・川路山遺跡・崩野遺跡・役所田遺跡・上田代遺跡・松添遺跡・平畑遺跡・平畑25区遺跡・高野原遺跡B.C区

鹿児島

ウフタ遺跡・柿内遺跡・南原内堀遺跡・出水貝塚遺跡・マツノト遺跡・水天向遺跡・鹿児島大学構内釘田第１地点・鹿児島大学構内桜ヶ丘遺跡・松木薗遺跡・草野貝塚遺跡・田中堀遺跡・上加世田遺跡・千河原遺跡・塚ヶ段遺跡・鳥巣ノ上遺跡・小倉前遺跡・上中段遺跡・宮之迫遺跡・小迫遺跡・山角遺跡・大中原遺跡・藤平小田遺跡・野大野A遺跡・満足山遺跡・一ノ坪遺跡・一陳長崎鼻遺跡・三本松遺跡・下剥峯遺跡・寺之門遺跡・鬼ヶ野遺跡・長浜金久遺跡・面縄第1貝塚遺跡・面縄第2貝塚遺跡・面縄第4貝塚遺跡・中町馬場遺跡・下曽瓦村遺跡・嘉徳遺跡・川嶺辻遺跡・一湊松山遺跡・南種子遺跡・川尻遺跡・川寺遺跡

沖縄

具志原貝塚遺跡・那崎原貝塚・高知口原貝塚遺跡・大堂原遺跡・屋部前田原遺跡・フェンサ城貝塚遺跡・溝原遺跡・大嶺村遺跡・与那覇城遺跡

国内（九州以外）

北海道

舘崎遺跡・幌内遺跡・釜谷10遺跡・幸連4遺跡

青森

三内丸山遺跡・岩渡小谷遺跡・近野遺跡

宮城

山居遺跡

千葉

取掛西貝塚遺跡

東京

下宅部遺跡・日向北遺跡

富山

小竹遺跡・桜町遺跡・平岡遺跡

福井

鳥浜貝塚遺跡

岡山

高島黒土遺跡・三和遺跡・南溝手遺跡・上東中島遺跡・津島岡大鹿田遺跡・津島岡大遺跡・窪木遺跡・百間川沢田遺跡・前池遺跡

香川

なつめの木貝塚遺跡・永井遺跡

高知

松ノ木遺跡

海外

中国

文家屯遺跡・照格荘遺跡・霊井遺跡・廟后遺跡・王家村遺跡・上馬石貝塚遺跡・京都羊頭窪遺跡・田螺山遺跡・良渚遺跡・上山遺跡・達沢廟遺跡・楼子庄遺跡・午台遺跡・殻丘頭遺跡・跨湖橋遺跡・大仲家遺跡

韓国

大川里遺跡・松竹遺跡・中山洞遺跡・桐華里遺跡・凡方遺跡・凡方貝塚遺跡・新堂里遺跡・三徳洞遺跡・東三洞貝塚遺跡・細竹里遺跡・飛鳳里遺跡・竹邊里遺跡

ロシア

ハロヴァ遺跡・ポシェット周辺遺跡・クロノフカ遺跡・ザイサノフカ遺跡

モンゴル

ウランバートル大学遺跡・タムリン ウラーン ホショー遺跡・ボロー遺跡・ハタン ツォヒョー遺跡・ヘルレン・デニ遺跡・ウラン シベリンアム遺跡・ズーンサラー遺跡・グリーン フンティー遺跡・エルスト アル遺跡

台湾

嶺頂遺跡・石橋遺跡